Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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GAPVD1Q14C86 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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GAPVD1Q14C86 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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GAPVD1Q14C86 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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GAPVD1Q14C86 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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