Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CUL4AQ13619 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CUL4AQ13619 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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