Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MIR296-201ENST00000385215 80 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PPP1R14D-202ENST00000427255 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ISX-AS1-201ENST00000427881 202 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PRDX2P4-201ENST00000447134 600 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SLC25A15P2-201ENST00000457292 338 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 KLF7P1-201ENST00000490941 1048 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PHBP19-201ENST00000547512 754 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC025198.1-201ENST00000578331 419 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PDLIM1P2-201ENST00000582923 607 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC073869.3-201ENST00000609270 580 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AMPD1-201ENST00000369538 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC008966.1-203ENST00000499459 3137 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CALCR-205ENST00000421592 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LIMCH1-215ENST00000512632 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ADAM21P1-201ENST00000529267 2170 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LRRC4C-203ENST00000528697 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC114980.1-201ENST00000505668 3157 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TRERF1-201ENST00000340840 4174 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 VSIG4-201ENST00000374737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC091013.1-201ENST00000499752 3734 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 JAKMIP2-202ENST00000333010 2992 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 B4GALT6-202ENST00000306851 3891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CREM-204ENST00000345491 2220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SIRPB1-213ENST00000568365 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC01299-201ENST00000520902 2634 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LANCL1-201ENST00000233714 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TRY2P-202ENST00000616556 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 BICC1-201ENST00000263103 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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MKRN4PQ13434 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RASSF2-201ENST00000379376 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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MKRN4PQ13434 POLR2J3-215ENST00000511313 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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MKRN4PQ13434 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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MKRN4PQ13434 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL442663.4-201ENST00000555304 289 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC119751.8-201ENST00000597032 156 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PCDH11Y-202ENST00000333703 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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