Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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ITGB3BPQ13352 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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ITGB3BPQ13352 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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ITGB3BPQ13352 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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ITGB3BPQ13352 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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