Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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