Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms