Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 KNG1-202ENST00000287611 1720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CACNA1BQ00975 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms