Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SEMA4D-201ENST00000339861 4258 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PIK3R3-201ENST00000262741 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 IL17A-201ENST00000340057 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RASGRP4-202ENST00000426920 2650 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MAB21L1-201ENST00000379919 3028 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL512326.3-201ENST00000424885 171 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL161638.2-201ENST00000427319 507 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL451062.1-201ENST00000437753 469 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL023284.4-201ENST00000564248 374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CCDC163-207ENST00000629482 953 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC01002-228ENST00000633402 565 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FHAD1-202ENST00000358897 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 C14orf93-201ENST00000299088 3354 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TCF7-202ENST00000378560 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 KBTBD4-204ENST00000526005 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FAM86EP-201ENST00000313946 2845 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ARMC2-203ENST00000392644 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL031283.2-201ENST00000428747 3105 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AKAP13-221ENST00000560579 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 EMC1-201ENST00000375199 5408 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC02239-201ENST00000504339 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MOV10L1-209ENST00000540615 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 C17orf80-205ENST00000535032 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FCRL5-203ENST00000368190 2800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 EPHB2-202ENST00000374630 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PIGN-223ENST00000638369 4205 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PDGFD-202ENST00000393158 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PIK3CG-202ENST00000440650 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LCLAT1-202ENST00000319406 2774 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF596-202ENST00000320552 2696 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SALL1-202ENST00000440970 5253 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 IL22RA2-202ENST00000339602 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 BICD1-201ENST00000281474 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF263-201ENST00000219069 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TTTY1B-201ENST00000250776 910 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TTTY1-201ENST00000250805 910 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 OR4K14-201ENST00000305045 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PCP4-201ENST00000328619 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GAPDHP64-201ENST00000419696 1003 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ORM2-201ENST00000431067 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TRAF3IP2-AS1-207ENST00000456352 484 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC010319.1-201ENST00000526892 1258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC006927.1-201ENST00000544818 498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC009414.2-201ENST00000565283 366 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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