Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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LINC00587B1AMM8 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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