Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S4R3C0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S4R3C0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S4R3C0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S4R3C0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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