Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMC3Q9Y6N6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMC3Q9Y6N6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMC3Q9Y6N6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms