Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms