Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH4Q9UQ05 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH4Q9UQ05 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH4Q9UQ05 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms