Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms