Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNIKQ9UKE5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms