Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms