Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGA1Q9UJY5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms