Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms