Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REV1Q9UBZ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms