Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CNTN3Q9P232 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN3Q9P232 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms