Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHRF1Q9P1Y6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHRF1Q9P1Y6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms