Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms