Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms