Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms