Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM7Q9NR12 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms