Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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LHX9Q9NQ69 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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LHX9Q9NQ69 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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LHX9Q9NQ69 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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LHX9Q9NQ69 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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LHX9Q9NQ69 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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LHX9Q9NQ69 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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LHX9Q9NQ69 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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LHX9Q9NQ69 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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