Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC4Q9NPP4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms