Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZC3H12CQ9C0D7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZC3H12CQ9C0D7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms