Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms