Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT17Q9BSW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT17Q9BSW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms