Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms