Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms