Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD5Q99666 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD5Q99666 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD5Q99666 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD5Q99666 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD5Q99666 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD5Q99666 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD5Q99666 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD5Q99666 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms