Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAM1Q96QH2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms