Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP4Q96PP9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.3 ms