Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF4Q96M43 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms