Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms