Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BORCS6Q96GS4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms