Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD4Q96DM1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms