Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms