Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms