Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms