Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms