Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP4Q8N2S1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms