Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms