Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms