Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms