Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TYW3Q6IPR3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms