Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF20Q5VT98 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF20Q5VT98 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms