Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms